Lo sviluppo di un flusso di lavoro NGS standardizzato deve affrontare molte sfide scientifiche e tecniche.
Per affrontare al meglio queste sfide il progetto è stato diviso in diversi moduli:
- Modulo 1: Pre-sequenziamento: raccolta dei campioni, isolamento del DNA e controllo di qualità.
- Modulo 2: Sequenziamento, comprendente:
- a) insieme di geni responsabili del cancro,
- b) Geni farmacogenomici.
Una commissione di ricerca per i tumori molecolari esamina questi dati, con l'aiuto dell'intelligenza artificiale, e identifica il farmaco più adatto. Quando la commissione non individua una terapia, resta responsabilità dell'oncologo suggerire un trattamento.
- Modulo 3: analisi bioinformatica:
- a) trasferimento dati
- b) biostatistica
- Modulo 4: e-reporting (refertazione elettronica): visualizzazione dei risultati NGS progettata in base alla richiesta del medico e alle esigenze dei pazienti.